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弘光五年九月一日，己丑科会试终于在众多士子的翘首以盼中开始了。
对于己丑会试时间的推迟，大部分贡生的感觉是复杂的，没错，一方面朝廷特意留出时间以便光复区士子能参与今年会试，是一件值得歌功颂德的事情，但另一方面北方士子的加入必然增加了南方士子入仕的难度，这就是很多南方士子所不甘心的了。
有人一定会问题，大明会试不是分中南北三榜嘛，北方光复区士子的成绩怎么会影响南方士子入仕呢？
其实问题很简单，宪宗成化十一年后，大明会试以取士三百人为常数，如果这次会试不将光复区士子算上的话，今科三百人中大部分的名额将会成为南方士子的囊中之物，但由于北方光复区士子的参与，导致了相当一部分贡士名额将分给北榜得中者，这就无形中减少了南方士子中试比率，增加了南方士子之间的内部竞争，由不得南方士子心中苦闷。
不过，这些士子显然是多虑了，由于官制改制产生了大量的官缺以及光复区的官员配置也没有全面到位的缘故，朱由崧已经临时通知考场内的马士英等人，今科备取420名进士----明代会试一次性录取的最高记录是472人，取420人虽然突破了成化年以来的常例，但也不至于闹得百官反对----如此，三榜的录取人数都会有所增加的。
当然，目前的官缺不是多了120名新科进士就可以填满的，所以，预计三年后的壬辰科及六年后的乙未科，都会增加入取人数；此外，吏部还奉命更多的选任监生为官和吏员为官----虽然根据《官制改制方案·地方官员篇》中的规定，部分高级吏员直接可以被任命为从九品官员，但吏员为官实际上依旧不是一件简单的事情，有资格者必须先通过学部的特别考试和巡按的审核，才能由各道布政使上报给吏部文选司勾选，然后异地任职。
只是由于接下来要大量任用监生和吏员为官，所以，朱由崧一方面要扩大国子监的规模，以满足监生的职前教育----从弘光二年开始，国子监内监就在考核四书五经外，增加了文书、财务、刑律等方面的专业培训----需要，另一方面又为了安抚进士群体，而对监生出身的官员、吏员出身的官员的晋升做出了限制。
根据朱由崧的决定，在没有特殊贡献的情况下，进士出身的官员----甭管是进士及第，还是同进士出身----起步授官是正八品，然后每三年升一级；举监出身的官员----最新规定中，举人必须进入国子监完成三年专业培训才能安排官职----起步授官是从八品，然后每四年升一级；贡监、荫监出身的官员，也就是进入国子监前只有秀才功名的，起步授官是正九品，然后每五年升一级；吏员任官者起步是从九品，然后每六年晋升一级。
以进士为例，一名同进士初授正八品府经历或各道诸使衙署内知事、国子监监丞、各部寺从事----相当于平行时空的科员----行人等官，然后三年一迁，正常情况下，入仕三十三年后可以按部就班的升为正三品，再往上就不是年资能决定的，得看廷推结果，也就是派系人脉的比拼；
而举监初授从八品县教谕、各道诸使衙门照磨、国子监典簿、各寺监事等官，然后四年一迁，正常情况下，入仕四十年可以升迁到从三品，但往上走，就会遇到极大的天花板----原则上，各道巡抚是举监出身官员的极限。
贡监、荫监出身的官员，初授正九品县房主办、巡检、库丞、各县推官、各部寺低级从事等官职，正常情况下，入仕四十五年可以升到从四品，然后差不多就可以直接致仕了----原则上，知府是贡监、荫监出身官员的极限。
吏员出身的官员，初授从九品县房襄办、副巡检、渡丞、河泊所副使、市丞、中枢各部寺等官职，正常情况下，入仕四十八年可以升到从五品，届时也就到了退休年龄了----原则上，各州通判就是吏员出身官员能做到的最高位置······
“布政使、录事参军不应该只负责分配、调剂道、州府内官员的职务，应该承担起定期的考核的责任，”朱由崧跟孙传庭、张国维说道。“吏部文选、考功两司要负责偌大国家、成千上万官员的考核是不现实的，就算都察院帮忙监察也是顾及不周的，所以，应该给地方分一下权力，由道对州府主官以下州县官员进行初步考核，由州府对州县主官以下官员、吏目进行初步考核，相关考核结果一部分上交吏部，作为大计的参考，一部分则上交巡抚，由巡抚提请吏部做奖惩。”
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孙传庭和张国维应道：“是，臣等稍后将这部分职责编进去。”
“你们提的太仆寺驻各道转运使，朕觉得可以；但朕不认可大理寺在各道设置行寺的提议，应该降级为分寺、支司。”朱由崧继续说道。“另外，大理寺在州府一级，不合适用司理参军的名义，应该保留大理寺独有的官名，以便作为区分。”
朱由崧的意思是，司法独立，大理寺不是同级行政机构的下属单位，而是平级的，但这么一来，张国维便有意见了：“如果臣没有理解错误的话，臣以为陛下是不想让各级地方官府干预了大理寺的审案。”
朱由崧点点头：“巡按可以监察大理寺名下审判机构审案过程，但不得擅自干预！其余地方官府也亦然！”
张国维便道：“那臣以为设行寺更为恰当！”
大理寺正卿是正三品官，若各道设立分支的话，那分支的主官要从正四品往下算，相比巡抚可是低了一级甚至几级，说不是下属，可见了巡抚一样要矮一头的，但若是设立行大理寺的话，则可以定行寺主官为从三品，如此就与巡抚实现敌体了，除了监察一切的巡按，其他部门自然不敢对行大理寺颐指气使！
朱由崧却以为：“若各道再有一个从三品，真是滥授了······”